近年来，福建省从更高的起点加强原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新，并通过自主创新能力的提升，推进产业结构优化升级，加快形成以高新技术产业为先导、先进制造业为支撑的产业链，为加速海峡西岸经济区建设增添了新引擎、新动力。

    构筑海西高新产业基地

    为推动自主创新，福建省从电子信息、先进制造、生物医药、集成电路、光电子、新材料、新能源等方面入手，强化高新技术产业发展研究，推进高新技术产业重大技术突破。同时，培育一批科技型企业梯队，组织实施一批高新技术重大专项，努力构筑具有海峡西岸高新技术特色的产业基地。
    作为福建三大主导产业的电子信息、装备制造和石油化工，依托体系创新，调整发展方向，为海西发展注入活力。电子信息产业发展方向是移动通信和网络产品、数字视听产品、数字多功能电话机开发制造、新型电子元器件、软件开发生产及CAD、CAM、CAE系统开发生产等；装备制造业重点发展交通运输设备制造业、工程机械与港口机械等专用设备制造业、通用机械制造业、电子机械及器材制造业；石油化工产业关键是加快与石化龙头企业配套的中下游项目建设，延伸石化产业链，以及化学工业、新型环保涂料、林产化工、医药中间体等精细化工产品。
    企业是自主创新的主体，在产品开发研投、技术创新活动、创新成果应用等方面发挥重要作用。2009年，东南造船厂以定位科学的产品和自主创新，成为海西制造业的一个亮点。在开发中，该厂根据实际情况，安排1.3亿元三期技改资金，扩建新船台、购进新设备，提升整体造船能力，并在对国外新技术改进、消化、吸收的基础上进行了大量的改进、优化和创新，开发出为海洋钻井平台提供服务的高附加值59-75M大马力拖船。如今，东南造船厂每年在科研经费上投入1000多万元，正在建造的24-48M“金枪”渔船，具有完全的自主知识产权，已出口22艘，受到国内外用户的好评。
    在加快发展高新技术的同时，福建注重以高新技术和先进适用技术改造提升传统产业，促进传统产业集聚能力的增强。2009年，全省工业增加值4918亿元，增长12.1%。福建炼化一体化等一批项目建成投产，光电等一批新兴产业基地加快形成，同时，制定实施14个重点产业调整振兴方案，深入推进工业内涵深化技改提升工程，完成工业改扩建投资936亿元，增长49.7%。另外，实施帮扶措施，支持企业扩大融资，拓展营销，增强自主创新能力。

    拓展深化闽台产业合作

    近几年，福建省主动承接台湾高新技术产业的技术转移，实现技术创新与产业的对接。如鼓励、支持台商投资高新技术园区，吸引台湾科研机构和科技人员共同创建创新平台，建立长期稳定的闽台科技交流合作渠道，在资源环境、地质地震、气象、海洋等领域加强联合攻关。
    福建省在电子信息、装备制造、石油化工、现代农业等领域主动承接台湾科技产业的转移，支持海峡两岸合作创办集成电路设计、光电、软件、装备制造等闽台科技园区，推动两地高科技产业协同发展，努力使福建成为承接台湾高新技术产业与技术转移的载体。
    福建省在微生物药物研究、开发和产业化方面特色明显，而台湾在西药制剂、医疗机械和传统中药制剂等领域占有优势。现阶段，福建积极构建对台医药科技交流合作渠道，互派代表团寻找合作课题，制定更优惠的政策，引导台资投入医药科研和产业化事业，培育海峡西岸特色鲜明的高新技术医药产业集群。
    随着海西建设的持续推进，福建在两岸农业科技交流中的优势和特色日益凸显。多年来，福州大学催化剂国家中心积极开展汽车排放净化器研制，其产品已实现产业化。目前，科研人员正在研制高挥发性有机废气的治理，这些项目在台湾具有广阔的发展前景。福建农林大学校长郑金贵表示，将尽快收集祖国大陆农业科技成果，先在福建试种研究，再筛选出适宜成果到台湾示范栽培，促进两岸科技深度合作。